【J Hematol Oncol】南京中医药大学/南京大学团队依托PANDORA‑seq技术突破胃癌早筛瓶颈!血浆EV非经典小核酸标志物实现高灵敏早诊
- 2026-05-31 11:37:21
【J Hematol Oncol】南京中医药大学/南京大学团队依托PANDORA‑seq技术突破胃癌早筛瓶颈!血浆EV非经典小核酸标志物实现高灵敏早诊导读 胃癌（GC）是全球癌症死亡主要诱因之一，早期诊断率低严重制约治疗效果与患者生存。 传统肿瘤标志物灵敏度不足，液体活检成为突破方向。 细胞外囊泡（EV）携带的稳定RNA是肿瘤诊断理想标志物，但受RNA修饰干扰，非经典小非编码RNA（sncRNA）的胃癌诊断价值长期未被充分挖掘。 
本研究依托PANDORA‑seq技术突破RNA修饰测序障碍，首次绘制胃癌血浆EV非经典sncRNA全景图谱，筛选出3‑rs/tsRNA组合标志物，实现胃癌高灵敏、高特异早期诊断，为无创早筛提供全新方案。 
本研究通过构建多队列筛选‑验证‑机制完整体系，技术路径清晰可复制： 初筛队列：30例胃癌vs 30例健康人，PANDORA‑seq测序筛选差异sncRNA 训练队列：24例胃癌vs 24例健康人，RT‑qPCR验证候选分子 验证队列：143例胃癌vs 167例健康人，评估单分子与组合诊断效能 独立测试队列：两组外部样本进一步确证稳定性 功能机制：生信预测+双荧光素酶+Western blot验证靶基因与通路 术后监测：20例患者术后水平变化评估复发监测价值 PANDORA‑seq测序实验方法、步骤、原理、分析内容、技术优势： 
PANDORA‑seq技术细节、方法、样本准备、发表文章、方案设计、详细方案咨询请扫码联系： 
1.胃癌血浆EV非经典sncRNA表达谱异常，rs/tsRNA是核心差异分子 研究采用PANDORA‑seq技术，成功突破RNA修饰导致的测序终止问题，首次完整呈现胃癌血浆EV中小非编码RNA的全貌。测序共检出197个miRNA、519个piRNA、12789个rsRNA、1553个tsRNA、787个snoRNA，其中rsRNA与tsRNA数量最多、变化最显著。 按照严格筛选标准（RPM>10，FC>10），共鉴定出43个在胃癌中显著异常表达的sncRNA，其中上调分子以tsRNA和rsRNA为主，下调分子包含piRNA等其他类型。聚类热图与散点图清晰显示，胃癌组与健康对照组sncRNA表达模式存在显著分离。 
在训练队列（24GC vs 24健康）中，对排名靠前的10个上调分子进行RT‑qPCR验证，最终确定6个sncRNA在胃癌EV中稳定高表达，为后续标志物筛选奠定基础。 在扩大验证队列（119 GC vs 143健康）中，进一步锁定S2、S7、S10三个分子在胃癌中持续高表达，组间差异极显著。 （1）单分子诊断效能： S2：AUC=0.86，灵敏度79.72%，特异度82.63% S7：AUC=0.73，灵敏度54.55%，特异度88.62% S10：AUC=0.86，灵敏度71.13%，特异度86.23% （2）三分子联合诊断效能： 总队列AUC=0.91，灵敏度80.42%，特异度87.43%Ⅰ期早期胃癌AUC=0.88，灵敏度81.97%，特异度81.44%。 
研究进一步构建随机森林机器学习模型，对比3‑sRNA模型、传统临床指标模型（CA19‑9、CEA、CA125、AFP）、联合模型： 为确保临床实用性，研究在两个完全独立的测试队列中开展盲法验证： 测试队列1（47 GC vs 47健康）：组合AUC=0.97，灵敏度93.6%，特异度91.5% 测试队列2（40 GC vs 43健康）：组合AUC=0.91，灵敏度85%，特异度95.4% 跨队列、大样本验证证实该标志物稳定性强、重复性好，具备临床转化潜力。 
同时，对20例胃癌患者进行术后追踪检测，发现S2/S7/S10水平在手术后显著下降，提示该组合可用于术后微小残留病灶监测、复发风险预警，弥补传统影像学滞后性。 通过RNAhybrid、miRanda、GO/KEGG、双荧光素酶报告基因、Western blot等多层验证，明确三条分子的作用机制： S2：直接结合并抑制ErbB通路（CDKN1A、PAK3）与Hippo通路（NF2、TEAD3、LATS1） S7：靶向调控Hippo通路关键分子（SMAD4、BMP5） S10：作用于ErbB通路（NRG4、PRKCA）与Hippo通路（LIMD1、PPP2R1B、WTIP） 这些通路均为胃癌发生、侵袭、转移的核心通路，证明该标志物不仅是诊断指标，还可作为潜在治疗靶点。 1.理论意义 首次用PANDORA‑seq全面解析胃癌血浆EV非经典sncRNA，突破传统miRNA研究局限，揭示rs/tsRNA通过ErbB/Hippo通路调控胃癌的新机制。 2.方法意义 建立 “高通量测序+多队列验证+功能机制”的EV‑sncRNA标志物开发范式，为消化道肿瘤液体活检提供标准化路径。 3.转化意义 3-rs/tsRNA组合实现胃癌无创、高灵敏早筛，优于传统肿瘤标志物，可用于高危人群筛查、早期诊断、预后监测，推动胃癌精准诊疗落地。 本研究成功开发血浆EV来源3-rs/tsRNA胃癌早诊标志物，早诊性能优异、机制明确。该标志物可实现无创、快速、精准胃癌筛查，有效弥补临床早诊短板，兼具诊断与靶向治疗双重价值，有望快速走向临床转化。 
近日，南京中医药大学、南京大学联合团队在Journal of Hematology & Oncology（IF：40.4，JCR/中科院：1/1区）发表研究Non‑canonical small noncoding RNAs in the plasma extracellular vesicles as novel biomarkers in gastric cancer。
方案设计&流程
主要内容&结果
2. 3‑rs/tsRNA组合标志物诊断性能优异，远超传统临床指标
- 3‑sRNA模型：AUC=0.95
临床指标模型：AUC=0.70 联合模型：AUC=0.95，总灵敏度提升至83.9%
结果表明，该RNA标志物组合远优于现有肿瘤标志物，可显著提升胃癌检出率。真正实现早期胃癌无创精准识别。
3.多中心独立队列验证稳定，可用于术后复发与残留监测
4.机制明确：直接调控ErbB/Hippo通路，兼具诊断与治疗价值
研究意义&总结
【Nat Commun】东南大学医学院附属中大医院刘必成/吕林莉团队通过PBA技术发现脓毒症急性肾损伤早期预测标志物——CD35阳性尿液细胞外囊泡
【Sci Rep】全外显子组和甲基化组捕获新技术，Twist酶法可实现对FFPE样本快速高效构建单链DNA测序文库
【Nat Med】复旦大学焦娜/中山大学朱立新/同济大学朱瑞新团队评述，微生物定量技术的准确性、严谨性以及控制混杂变量的重要价值
国自然热点“乳酸化修饰”新文章：组蛋白乳酸化通过METTL3介导的m6A修饰调节ACSL4促进脓毒症肺损伤的铁死亡机制
【JCSM】东南大学高伟教授联合南京医科大学鲁翔教授团队成果，外周血FGF2甲基化可作为筛查和评估肌少症的生物标志物
【Nat Immunol】新兴表观遗传学标记物：DNA羟甲基化方法综述和最新应用！
Driving innovation for better life！
本文来自网友投稿或网络内容，如有侵犯您的权益请联系我们删除，联系邮箱：wyl860211@qq.com 。
