南京大学生命科学院陈迪俊副教授，主要从事基因转录调控的生物信息学研究。近期，发表相关研究成果。
第一篇Cell Genomics
为了打通生命科学领域单细胞多组学和空间组学之间信息壁垒，陈迪俊团队发表题为“Robust integration and annotation of single-cell and spatial omics data using interpretable gene programs”的论文，开发了一款称为SSpMosaic的新神器，采用一种叫“基因模块”的逻辑，打破了数据间的壁垒。SSpMosaic 通过引入可解释的基因元模块，为单细胞和空间组学研究提供了一个统一、透明且功能强大的计算框架 。它不仅解决了“黑盒”模型难以解释的问题，更在处理异质、多模态数据时展现了极高的精确度和稳健性。该研究同时启发我们：探寻生命的奥秘，不应只局限于盯着孤立的“基因零件”，更应审视它们是如何被编排成一套套精妙的“程序模块”。
第二篇Arthritis & Rheumatology
强直性脊柱炎（Ankylosing spondylitis，AS）和附着点炎相关关节炎（Enthesitis-related arthritis，ERA）同属自身免疫性骨病，均以异位骨化为突出表现，预后不良，发病机制仍待阐明。针对上述难题，孙洋/陈迪俊团队，联合南京市儿童医院樊志丹/俞海国团队发表题为“XCR1+ Conventional type 1 dendritic cells exacerbate the inflammation in osteogenic arthritis through IL-17A+CD8+ T cells”的论文，共同揭示了XCR1+ 1型常规树突状细胞（XCR1+ cDC1）与IL17A+CD8+ T细胞互作在成骨性关节炎中的关键致病作用，具体来说，XCR1+ cDC1通过MHC Ⅰ 抗原呈递激活CD8+ T细胞，活化的CD8+ T细胞进一步通过分泌XCL1招募XCR1+ cDC1，从而形成正反馈循环加剧了成骨性关节炎。综上，该研究揭示了成骨性关节炎发病的新机制，并提出靶向中和XCL1是一种有效的干预策略。
第三篇Genome Biology
组蛋白修饰（histone modification）是表观遗传调控的重要层面，能够在不改变 DNA 序列的情况下影响染色质状态与基因表达，在不同植物物种与组织条件下系统获取组蛋白修饰图谱通常依赖高成本实验，且数据分布不均衡，限制了大规模比较与功能注释。为解决上述难题，陈迪俊团队发表题为“Cross-species prediction of histone modifications in plants via deep learning”的研究，团队提出深度学习框架 SeiPlant，可基于 DNA 序列对组蛋白修饰进行预测，并在跨物种场景中展现出良好的泛化能力，为非模式植物的表观组推断与调控元件研究提供了新的计算工具。展望未来，将 SeiPlant 与环境胁迫条件下的多组学数据、组织/细胞类型分辨的表观数据以及三维基因组结构信息（如 Hi-C 相关特征）相结合，有望进一步提升对表观遗传调控动态与空间组织机制的解析能力，并服务于作物性状改良与适应性机制研究。
相关链接：
https://www.cell.com/cell-genomics/fulltext/S2666-979X(25)00361-1
https://acrjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/art.70069
https://doi.org/10.1186/s13059-025-03929-4
https://github.com/compbioNJU/SeiPlant
