医院旧址位于南京市鼓楼区江边路46、48号（原龙江路30号），现存南楼与北楼两栋主体建筑，整体格局基本完整。南楼为长条形住院部，面积约1200至1363平方米，砖木结构，青砖灰瓦，外观朴素而庄重；北楼呈凹字形，面积约800平方米，原为门诊部或手术室，中间围合庭院，体现功能性布局。建筑群融合中西风格，既有中式屋架、飞檐雕花，又采用西式罗马柱、拱形回廊与宝瓶栏杆，形成“穿西装戴瓜皮帽”式的独特风貌。院内原有回字形道路与数十棵法国梧桐林荫道，营造出静谧的疗愈环境，至今仍保留部分原始肌理。该建筑群于1930年前后基本建成，解放后曾作为724研究所职工宿舍及海军学校用房，部分建筑被改建或占用，瞭望塔（高23米，钢架结构）已于2009年拆除。2014年，因滨江风光带建设规划，旧址一度面临拆除风险，经南京市文物局组织专家论证，最终决定就地保留并启动修缮工程。东南大学建筑学院周琦教授团队主导修复，采用钢结构加固、绞合支架技术处理墙体开裂，并对排水系统进行优化，首期工程耗时70天完成。2025年，针对罗马柱风化、墙体渗水等问题，实施1:1原样翻制工艺，最大限度保留历史原貌。作为全国现存极少的近代军事医院建筑之一，民国海军医院旧址不仅见证了南京近代医疗发展与海军历史，也体现了民国时期中西建筑文化的交融。其地理位置优越，北临长江，西接滨江风光带，已成为南京历史文化步道中的重要节点。
以下为修缮前的照片：
