① 中加国际高中班
南京市第十三中学国际部中加班于 2004年创办，2005 年正式招生，是经江苏省教育厅、加拿大安大略省教育部 “双批准”的国际高中，是十三中与加拿大邦德多伦多国际学院 ( Bond International College) 联合创办的中加国际高中(3+0)项目，也是江苏最早在加拿大安省正式注册的学校之一。历届毕业生加拿大前3大学录取率超90%，全球前100大学录取率100%。
② 中美国际高中(AP)班
南京市十三中在多年严谨办学的基础上，2017年开设了中美国际高中项目，学校与美国缅因州当地中学共同研发，将双方优势学科与AP课程深度融合，打造更适合南京本地学生的课程体系。递进式的教学模式更适合学生的多层次发展。中美班毕业生100%收到美国TOP60大学的录取，90%以上世界名 校录取率，成绩斐然。
