
农业科学研究(中英文)青年编委袁军教授
袁军,男,博士,教授,博士生导师,南京农业大学资源与环境科学学院副院长,国家优秀青年基金获得者,国家大宗蔬菜产业技术体系连作障碍克服岗位科学家。是沈其荣院士团队根际互作生物学课题组负责人,研究方向为根际微生物组调控,连作生物障碍克服,植物-土壤反馈,新型肥料研发等。目前以第一或通讯作者在Nature Communications, The ISME Journal,Protein & Cell,Microbiome, Molecular Plant,New Phytologist,Science China Life Science,Fundamental Research,Plant Cell and Environment,Soil Biology and Biochemistry,Horticulture Research等期刊上发表SCI收录论文40余篇;所发表论文累计被引4000余次,H因子为35,申请和授权国家发明专利13项。

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①解析连作系统的致病机制,增强土壤瓜氨酸降解功能缓解土传镰刀菌枯萎病

原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-026-68606-x
该研究发现在西瓜根际土壤中发现发病初期土壤与促病土壤中的瓜氨酸含量显著高于健康及抑病土壤。进一步发现根际的瓜氨酸积累促进了尖孢镰刀菌毒素产生的增加,同时也相对抑制了有利于镰刀菌的土壤中的瓜氨酸周转功能。通过在西瓜、南瓜和黄瓜的连续种植试验中施用工程菌群EO-arcB的处理组病害发生率显著降低,植株生长状态明显改善,结果证实导入arcB基因增强土壤微生物的瓜氨酸降解能力,可有效阻断该致病链条。这些发现突显了利用无处不在的本土工程微生物群落来中和病原体衍生毒素的潜力,未来,通过激发土著微生物功能或开发携带关键基因的工程菌剂,有望建立起更精准、可持续的土传病害绿色防控体系。

南京农业大学博士生丁哲旭、博士后文涛论文共同第一作者;袁军教授为通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金(42322708、42090060、42277297、42307394)、中央高校基本科研业务费专项资金(KJJQ2025017、YDZX2025045)、国家现代农业产业技术体系(CARS-23)和中国博士后科学基金(BX20230160)的联合资助。

②发现黄酮类化合物介导的细菌亚精胺生物合成可促进番茄果实中维生素的积累
番茄是全球广受欢迎的高价值果蔬,其营养价值(尤其是维生素含量)是重要品质指标。如何安全、高效地提升果实维生素含量是农业研究的目标之一。植物根系会分泌大量化学物质到土壤中,形成根际这一特殊微区。这些分泌物,特别是类黄酮,能像“招募信号”一样,吸引有益微生物(植物根际促生菌,PGPR)在根周聚集,帮助植物抵抗病害和逆境。尽管知道根际微生物能促进植物生长,但它们是否以及如何影响果实发育后期的品质,特别是维生素等次生代谢物的积累,此前并不清楚。类黄酮信号如何被微生物“解读”,微生物又如何“反馈”给植物从而提升果实品质,是一个有待破解的“黑箱”。
2026年1月12日,西北农林资源环境学院来航线教授团队联合袁军教授在Nature Communications 发表题为“Flavonoid-mediated bacterial spermidine biosynthesis enhances vitamin accumulation in tomato fruits”的论文。阐明了黄酮类化合物介导的植物和根际微生物之间的跨界互作对番茄维生素积累的多层次调控作用与机制。

原文链接:https://doi.org/10.1038/s41467-025-68244-9
该研究发现,当番茄植株过量表达SlMYB12基因时,与生长在自然土壤中的野生型番茄相比,这类番茄果实中的维生素含量显著提高,并且会向根际土壤分泌大量的黄酮类化合物。值得注意的是,这一品质改善效果并非植物自身独立完成,而是高度依赖土壤微生物组的存在,尤其与根际土壤中溶杆菌(Lysobacter)等关键微生物类群的富集密切相关。多组学分析表明,番茄根系分泌的黄酮类化合物可通过刺激Lysobactersoli的蹭行运动“招募”溶杆菌更高效地向根系聚集;另一方面黄酮类化合物促进其亚精胺生物合成,反过来又促进了维生素的积累。进一步研究发现,溶杆菌中的RpoN扮演着“双重调控者”的关键角色。该蛋白能够感知番茄分泌的类黄酮信号,进而同步调控细菌的蹭行运动能力和亚精胺合成,最终介导微生物对果实营养提升的促进作用。这一调控路径的明确,完整揭示了类黄酮-微生物-植物果实品质之间的连锁反应机制。

西北农林科技大学资源环境学院博士研究生甫文疆为第一作者;西北农林科技大学资源环境学院来航线教授、郭俏副教授以和南京农业大学袁军教授为共同通讯作者。研究得到了“旱区农业新疆研究院”科技创新专项(XJHQNY-2025-6)、中国烟草总公司云南分公司重大科技专项(2024530000241022)、咸阳市“科学家+工程师”团队项目(L2024-CXNL-KJRCT-DWJS-0005)和陕西省重点研发计划(S2024-YF-ZDXM-NY-0223、S2024-YV-ZDCXL-ZDLNY-0162)的联合资助。

③挖掘保守的根际代谢物-微生物组互作帮助作物抗旱
面对全球变暖和极端干旱频发,单靠灌溉和传统育种已经越来越难以支撑农业生产的可持续发展。植物根际微生物被认为是“第二基因组”,但不同作物、不同地理环境下的菌群具有差异,有没有一套跨作物保守的根际抗旱方案?目前尚不确定不同作物是否能招募微生物以助其适应干旱,以及这种招募过程如何发生。2025年12月11日,袁军教授团队在Global Change Biology期刊上发表题为Deciphering Conserved Rhizosphere Metabolite–Microbiome Interactions for Crop Drought Resistance的研究论文,研究系统鉴定了跨作物保守的干旱响应根际微生物,并揭示了三种保守代谢物(海藻糖、肌醇与苯丙氨酸)能够招募干旱响应微生物帮助多种作物适应干旱。

原文链接:https://doi.org/10.1111/gcb.70652
研究团队围绕干旱胁迫这一全球粮食安全难题,利用 26 种作物(涵盖单子叶/双子叶及C3/C4作物)的根际微生物扩增子数据,筛选出在干旱条件下跨作物保守富集的 6 个干旱响应微生物(Streptomyces, Glycomyces, Inquilinus, Amycolatopsis, Acinetobacter 和 Promicromonospora),并在多作物共享的 46 种根际代谢物中,鉴定出海藻糖(trehalose)、肌醇(myo-inositol )和苯丙氨酸(phenylalanine) 三种可协同富集上述干旱响应微生物的关键代谢物。以这三种代谢物原位调控根际土壤微生物组,在番茄、黄瓜、西瓜的温室试验及高粱田间试验中,均显著提升作物适应干旱的能力。同时,这些代谢物驱动了与作物适应干旱相关的功能通路富集,帮助作物抗旱。纯培养结果进一步表明,链霉菌(Streptomyces) 能利用海藻糖合成并分泌苯丙氨酸(phenylalanine)以跨门招募不动杆菌(Acinetobacter),揭示了基于代谢物可能存在的跨门级微生物级联招募机制。该研究系统阐明了一种在多种作物中保守存在的“根际代谢物–微生物”互作模式,为通过原位调控土壤微生物组提升作物抗旱性提供了新策略。

南京农业大学博士生牛国庆和刘炜烨为论文共同第一作者;袁军教授为通讯作者。该工作得到了宁夏回族自治区中央引导地方科技发展资金(2025FRF05007)、国家自然科学基金(42322708)、国家现代农业产业技术体系(CARS-23)、山西省重点研发项目(202302140601007)及中央高校基础科研基金(KJJQ2025017)的联合资助。

④通过荞麦-甘蓝的轮作模型,探究微生物土壤遗留如何影响甘蓝的生长和根肿病抗性
前茬作物的生长遗留效应显著影响后茬作物的健康,然而作物轮作系统中土壤遗留效应通过根际植物-微生物组互作影响抗病性的机制仍不清楚。根肿病由土传原生生物芸薹根肿菌(Plasmodiophora brassicae) 引起,对全球十字花科作物生产构成毁灭性威胁,可导致10%至90%的产量损失,且预计在气候变暖情景下危害将加剧2025年7月29日,南京农业大学袁军教授课题组联合西南大学司军教授和宋洪元研究员团队在Microbiome期刊发表了题为“Soil microbial legacy mediated by buckwheat flavonoids enhances cabbage resistance to clubroot disease”的研究论文。该研究揭示了在荞麦-甘蓝轮作系统中,荞麦通过根系分泌的黄酮类化合物塑造有益土壤微生物产生遗留效应,并通过激活茉莉酸信号通路增强后续甘蓝对根肿病的系统抗性。

原文链接:https://doi.org/10.1186/s40168-025-02166-y
研究团队以荞麦-甘蓝轮作模型,探究微生物土壤遗留效应如何塑造甘蓝生长及其对根肿病的抗性。三年田间试验显示,荞麦轮作可持续降低根肿病发病率67%-97%,且该效应不受病原菌负荷影响。土壤灭菌消除了这种抑制作用,表明其机制与微生物有关。16S rRNA测序识别出荞麦富集的细菌分类群(Microbacterium、Stenotrophomonas、Ralstonia),这些菌群可定殖于后续甘蓝根系。代谢组学分析发现,荞麦根系分泌的两种黄酮类物质(6,7,4′-三羟基异黄酮和7,3′,4′-三羟基黄酮)是微生物群落重构的关键驱动因子。这两种黄酮协同增强了一个合成微生物群落(SynCom1,含Microbacterium keratanolyticum、Stenotrophomonas maltophilia和Ralstonia pickettii)的防病效果,在温室试验中使病害抑制率提高了34%。黄酮与SynCom1联合使用可提高细菌在根际生态位的定殖能力。尽管SynCom1部分激活了茉莉酸(JA)相关防御反应,其防病效果主要依赖于黄酮介导的微生物招募,而非直接的免疫诱导。

总之,研究结果表明荞麦通过建立一种黄酮介导的微生物遗留效应来抑制甘蓝根肿病。关键是这种抑制是通过激活由植物-微生物组互作引发的宿主防御反应介导的,而非直接病原菌拮抗。值得注意的是,与微杆菌属(Microbacterium)、劳尔氏菌属(Ralstonia)和窄食单胞菌属(Stenotrophomonas)相关的类群在荞麦种植下富集,并随后作为土壤遗留物保留在后续甘蓝作物的根际中。这种根际生态工程策略为依赖化学制剂的实践提供了一种可持续的替代方案。
西南大学园艺园林学院博士研究生吴嘉炳和胡世琳为共同第一作者;西南大学园艺园林学院司军教授和宋洪元研究员、南京农业大学袁军教授为共同通讯作者。研究得到了国家自然科学基金(U22A20506、32472871、32341054)、宁夏重点研发计划项目(2024BF01007、2023BCF01006)以及国家现代农业产业技术体系专项资金(CARS-37)的支持。
值得一提的是,植物科学领域国际顶级综述期刊 Trends in Plant Science 在12月11日就这项研究进展发表了题为 “Root-driven microbiome memory enhances plant disease resistance” 的 Spotlight(焦点评述)文章 。文章将这一发现定义为一种“拉马克式”的代际适应性免疫策略,认为植物将与微生物互作的经验通过化学和表观遗传的方式编码,并传递给后代。


⑤揭示植物根际菌群代谢介导的地上虫害防御机制及新型合生元开发
在自然界中,植物并非被动地承受外界压力,而是通过一系列精妙的生理与分子机制主动应对环境挑战。植物在遭受地上部害虫侵食时,不仅依靠叶片的防御系统作出反应,还会通过地上—地下信号传导调控根际微生物群落的重塑,构建积极的土壤遗留效应,从而增强后续植物的抗虫性。然而,植物如何通过地下根际微生物响应地上部害虫胁迫,并形成可持续的土壤记忆,仍是一个未解之谜。2025年11月3日,袁军教授课题组在Molecular Plant发表了题为“Design of effective synbiotics against aboveground insect herbivory through characterization of host plant rhizosphere microbiota and metabolites”的研究论文 。揭示了植物如何通过地上—地下互作调控根际代谢物和微生物组,实现“cry-for-help”反应,并据此设计出一种结合氨基酸与假单胞菌的高效抗虫根际合生元。

原文链接:https://doi.org/10.1016/j.molp.2025.09.016
研究团队提出了植物“cry-for-help”反应的完整机制模型:当植物受到地上部害虫取食时,根部会释放特定氨基酸类代谢物,这些代谢物能够吸引并促进假单胞菌在根际的积累;富集的假单胞菌再通过地上—地下互作反馈激活植物的茉莉酸信号通路,诱导防御相关代谢物(葡萄糖苷类)积累,从而增强植物对地上害虫的抗性。基于该机制构建的氨基酸–假单胞菌合生元可有效激活植物的地上—地下互作防御反应,为绿色农业害虫防控提供了新的理论与实践路径。详见我刊青年编委、南京农业大学袁军教授课题组发表最新成果——根际“合生元”帮助植物抵御地上害虫侵食

南京农业大学杨盛蝶博士为第一作者;袁军教授为通讯作者。研究得到了国家自然科学基金(42322708)、国家现代农业产业技术体系(CARS-23)、山西省重点研发计划(202302140601007)、中央高校基本科研业务费专项资金(KJJQ2025017)和中国博士后科学基金(BX20230160)的联合资助。

编辑|胡光明
责编|魏乐
审核|奥海玮
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