南京医科大学是国家“双一流”建设高校，作为首批教育部、国家卫生健康委员会与江苏省人民政府共建医学院校，其办学历史可追溯至1934年创建的江苏省立医政学院，历经国立江苏医学院、南京医学院等发展阶段，1993年正式定名南京医科大学，如今已成为江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校。
学校办学格局完善，现有江宁、五台两大校区及筹划中的常州校区，校本部教职工超2000人，汇聚了包括8名中国工程院、科学院院士（含工作站）、1名美国国家医学院外籍院士在内的顶尖人才，国家级高层次人才达162人次，组建了3个“全国高校黄大年式教师团队”等一批高水平教学科研团队，为办学质量提供坚实支撑。
学科建设成效卓著，公共卫生与预防医学入选国家“双一流”建设学科，在全国学科评估中获评A+等级。学校拥有3个国家重点学科、1个国家重点（培育）学科、40个国家临床重点专科，14个学科跻身ESI全球排名前1%，其中临床医学、药理学与毒理学等3个学科进入前1‰。学科覆盖医学、理学、工学等7大门类，构建了完善的学位授权体系，包括7个一级学科博士点、6个博士后科研流动站，形成了多层次、全方位的学科发展格局。
人才培养质量优异，设有19个学院，25个本科专业，开设3个本（硕）博贯通培养和3个“5+3”本硕一体化专业方向，国家级一流本科专业建设点占比近八成。学校入选教育部基础学科拔尖学生培养计划2.0基地，建有众多国家级教学平台，斩获8项国家级教学成果奖。毕业生执业医师资格考试通过率稳居国内同类院校前列，就业率持续保持在96%以上，为医疗卫生行业输送了大批优秀人才。
科研创新实力雄厚，建有生殖医学与子代健康全国重点实验室等50多个国家级、省部级科研平台，承担近百项重大国家科技计划项目。研究成果频频发表于《自然》《科学》等顶级期刊，斩获以国家自然科学二等奖为代表的诸多奖项，同时依托江苏省健康研究院这一省内唯一省级卫生政策智库，为健康中国战略提供智力支持。
学校坚持开放办学，与美国、瑞典等多个国家及港澳台地区的院校建立深度合作关系，在2025年软科排名中位列全国第52名，医药类高校排名稳居前列。面向“十四五”，南京医科大学以“博学至精、明德至善”为校训，聚焦一流学科、一流附属医院和一流办学条件建设，正全力朝着特色鲜明的“双一流”医科大学目标迈进，持续为我国医疗卫生事业发展贡献力量。
