南京水利科学研究院建于1935年,原名中央水工试验所,是我国最早成立的综合性水利、交通、能源科学研究机构;2001年被确定为国家级社会公益类非营利性科研机构。
主要从事基础理论、应用基础研究和高新技术开发,承担水利、交通、能源等领域具有前瞻性、基础性和关键性的科学研究任务。设有水利部大坝安全管理中心、水利部水闸安全管理中心、水利部应对气候变化研究中心、国家水文计量站、水利部基本建设工程质量检测中心、水利部水文仪器及岩土工程仪器质量监督检验测试中心、水利部大坝安全监测中心。
历经90年的发展,南京水利科学研究院已发展成为拥有60多个具有鲜明特色和专业优势的研究方向、在国内外具有重要影响的综合性水利科研机构。