目前，车站地下结构施工已全部完工。站房二标段出站层施工顺利完成，即将启动站房钢屋盖结构施工作业。为了保证项目如期完工，五一假期南京北站项目没有停工，现场一派热火朝天的建设景象，约3700名建设者坚守施工一线，加紧昼夜施工，全面冲刺站房主体结构关键施工节点。2024 年9月 正式动工，进入实质性施工阶段。
2024.9–2025年底 桩基、基坑支护、土方开挖；地铁 3 号线、S4 号线等下穿结构同步施工。
2026年1月底 完成正负零以下全部结构（地下结构完工），全面转入地上施工。
2026 年1月 北广场结构100%完成，南广场70%完成；出站层完成60%、承轨层40%、高架层20%。
2026年4月底 计划完成承轨层结构。
2026年6月底 计划高架候车层混凝土结构全面封顶。
作为南京唯一集高铁、城际、普速铁路于一体的铁路枢纽，南京北站具备全向发车能力。项目采用地上四层、地下两层布局，凭借16台30线（高铁场5台9线、城际场6台12线、普速场5台9线）的规模，成为北沿江高铁沿线的最大枢纽。项目建成后，将与南京南站、南京站“三站”联动，形成以南京为中心的1.5小时高铁交通圈。与此同时，项目同步规划建设14.4平方公里枢纽经济区，预计将集聚10万人口，有效驱动江北产城深度融合，与南京南站形成“双核驱动”的城市发展新格局，补齐南京“米”字形高铁网的关键拼图。
