学校由创建于1953年的中国人民解放军军事工程学院分建而成，经历了中国人民解放军炮兵工程学院、华东工程学院、华东工学院等发展阶段，1993年更名为“南京理工大学”。1995年，成为国家首批“211工程”重点建设高校。2000年，获批成立研究生院。2011年，获批建设“985工程优势学科创新平台”。2017年，入选“双一流”建设高校。
截至2025年5月，学校有南京、江阴、盱眙（在建）3个校区，占地4326亩，校舍建筑总面积148.6万平方米；设有21个专业学院，以及钱学森学院、中法工程师学院、国际教育学院、创新创业教育学院、国家卓越工程师学院、新生学院、继续教育学院，2个独立学院，开设招生专业65个；拥有博士后流动站19个；一级学科博士学位授权点23个，一级学科硕士学位授权点36个，博士专业学位授权类别3个，硕士专业学位授权类别36个；有教职工3600余人，专任教师2400余人；各类全日制在校生34000余名，留学生700余名。
